A perspectiva adotada pela Casa da Arte de Educar é a da necessidade de uma composição de estratégias pedagógicas para que seja repensado o modo de funcionamento das instituições educativas, a fim de colocá-las na lógica da inclusão e da formação integral de crianças e adolescentes. A metodologia tem como ponto de partida o incentivo ao diálogo e as trocas entre grupos culturais distintos, através de uma pedagogia estruturada na valorização das experiências de cada grupo. Com base nestes aspectos, a Casa da Arte de Educar vem buscando aperfeiçoar-se e, atualmente a formação de todos os alunos é composta de trabalhos nos Núcleos de Pesquisa:

1. Núcleo de Pesquisas Artísticas – Neste núcleo realizamos pesquisas nas linguagens visual, musical e corporal a partir do confronto entre o interesse identificado na comunidade, a produção contemporânea e a história, e os desafios da linguagem abordada.

2. Núcleo de Pesquisa da Memória - Neste Núcleo são desenvolvidas oficinas de fotografia, vídeo e criação de textos com o objetivo de produzir reflexões acerca da identidade sociocultural das comunidades através do olhar do jovem para sua realidade, bem como da constituição de um banco de dados comunitário.

3. Núcleo de Pesquisas para Escola – Espaço de desenvolvimento e aprofundamento dos conteúdos escolares, com abordagem diferenciada da aprendizagem, buscando aliar os desafios escolares às outras atividades realizadas na Casa através dos saberes comunitários.

4. Núcleo Vi-Vendo a Cidade - Programa de educação urbana que realiza visitação à cidade por meio de parcerias com museus, centros culturais e marcos históricos da cidade do Rio de Janeiro. Compreendemos que a cidade possui em si uma dimensão educadora e buscamos garantir aos alunos experiências reais na cidade onde vivem.

5. Núcleo de Educação para Ciências - Promove o interesse pelas ciências através da difusão do conhecimento científico relacionando-o a diversas práticas locais.